B細(xì)胞是免疫系統(tǒng)中重要的免疫細(xì)胞,是介導(dǎo)機(jī)體體液免疫應(yīng)答的主要細(xì)胞群。其識(shí)別、結(jié)合抗原主要依賴B細(xì)胞受體(B cell receptor,BCR)。

BCR結(jié)構(gòu)

BCR是B細(xì)胞識(shí)別抗原的一種膜表面免疫球蛋白(Smlg),是由兩條重鏈(heavy chain,H)和兩條輕鏈(light chain,L)(κ或λ鏈)組成的四聚體,其中H鏈由65-100種可變區(qū)(VH)、2種多變區(qū)(DH)、6種結(jié)合區(qū)(JH)和恒定區(qū)(CH)四部分基因片段組成;L鏈由可變區(qū)(VH)、結(jié)合區(qū)(JH)和恒定區(qū)(CH)三部分基因片段組成。

BCR的基因重排及其機(jī)制

BCR胚系基因中,V、(D)、J基因片段之間由內(nèi)含子隔開,通過(guò)基因片段的重排,形成V(D)J連接,再與C基因片段連接,這樣才能編碼完整的Ig多肽鏈。IgV基因的重排主要通過(guò)重組酶(包括重組激活酶基因(activating gene,RAG)、末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(terminal deoxynucleotidrltransferase,TdT)、DNA外切酶、DNA合成酶等)。

正常個(gè)體的BCR多樣性表現(xiàn)明顯,能夠形成1011種以上的BCR,出現(xiàn)這種現(xiàn)象的原因有:

1.V、D、J基因片段重排造成的多樣性

H鏈和L鏈的V區(qū)各有3個(gè)氨基酸組成和排列順序高度可變的區(qū)域,這些區(qū)域能夠與抗原表位形成互補(bǔ)的空間構(gòu)象,稱為互補(bǔ)決定區(qū)(complementarities determining region,CDR):CDR1、CDR2和CDR3。這三種CDR均能夠參與對(duì)抗原的識(shí)別,共同決定BCR的抗原特異性。其中編碼CDR3的基因,由于其位于輕鏈V、J或重鏈V、D、J片段的連接處,可以通過(guò)V(D)J重排和V-D和D-J連接時(shí)插入或剪接數(shù)個(gè)核苷酸,來(lái)增加BCR的多樣性。

2.核苷酸序列組合造成的多樣性

眾多的V區(qū)基因片段的組合和輕重鏈的組合,以及眾多的V、D、J基因中,重排時(shí)每個(gè)基因片段只能取一個(gè),存在多種組合,以此來(lái)增加BCR的多樣性。

3.體細(xì)胞高頻突變?cè)斐傻亩鄻有?/p>

外周淋巴器官生發(fā)中心內(nèi)的成熟B細(xì)胞,在受到抗體刺激后,已重排好的V區(qū)基因(CDR3)突變頻率增高,稱為體細(xì)胞高頻突變,主要為點(diǎn)突變,非隨機(jī)性。

B細(xì)胞受體(BCR)測(cè)序

B細(xì)胞受體庫(kù)測(cè)序(B cell receptor repertor sequencing,BCR-seq)是以生物信息學(xué)(Bioinformatics)全面高速分析高通量測(cè)序技術(shù)(HTS)檢測(cè)靶向擴(kuò)增后的B細(xì)胞抗原識(shí)別決定性表面分子,即檢測(cè)BCR的H鏈和L鏈,該技術(shù)能夠全面解析BCR基因重排堿基序列,以及各序列的豐度??山沂綛細(xì)胞介導(dǎo)的體液免疫應(yīng)答耐受性以及免疫球蛋白的多樣性變化。

技術(shù)流程

  1. 分離B細(xì)胞,并提取樣本RNA。
  2. 逆轉(zhuǎn)錄RNA,獲得cDNA。
  3. CDR3受體庫(kù)制備:以cDNA為模板,再根據(jù)基因特點(diǎn),將免疫球蛋白重鏈可變區(qū)(IGHV)分為六個(gè)家族,并設(shè)計(jì)六條上游引物(包括90%以上V區(qū)基因):依據(jù)IgM、IgG、IgA序列設(shè)計(jì)3條下游引物,并根據(jù)個(gè)體的不同加上不同標(biāo)簽,即特異性引物。每個(gè)個(gè)體的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列都帶有特異性標(biāo)記,CDR3受體庫(kù)的PCR產(chǎn)物經(jīng)擴(kuò)增、純化后,所有樣本產(chǎn)物就能作為一個(gè)樣本進(jìn)行反應(yīng)測(cè)序。
  4. 高通量測(cè)序:通常的測(cè)序方法是用Roche 454高通量測(cè)序儀進(jìn)行單向測(cè)序。
  5. VDJ序列比對(duì):測(cè)出PCR產(chǎn)物的全長(zhǎng)后,可根據(jù)特異性標(biāo)記區(qū)分樣本,然后進(jìn)行分析

BCR測(cè)序的應(yīng)用方向

  1. 某些疾病的發(fā)病機(jī)制及早期監(jiān)測(cè)與診斷的探討等。
  2. 通過(guò)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)BCR CDR3受體庫(kù),可觀察藥物的治療效果。
  3. 將B細(xì)胞受體基因位點(diǎn)與某些疾病發(fā)生、發(fā)展進(jìn)行關(guān)聯(lián),可能為疾病的早期監(jiān)測(cè)或發(fā)病機(jī)制提供重要信息。
  4. 對(duì)機(jī)體腫瘤同源性進(jìn)行分析。
  5. 孤立性IgA缺乏癥等原發(fā)性免疫缺陷病人體細(xì)胞突變篩查。
  6. 移植排斥反應(yīng)中耐受,排斥反應(yīng)的預(yù)測(cè)和干預(yù)指導(dǎo)。