GST融合蛋白的表達與純化
純化實驗方法
材料準(zhǔn)備:菌種,雌性小鼠(6~8周齡),LB液體培養(yǎng)基,氨芐青霉素,細(xì)菌裂解緩沖液,吸附緩沖液,洗脫緩沖液等(材料未詳細(xì)列出,可根據(jù)實驗sop進行準(zhǔn)備)
GST蛋白提取步驟
- 復(fù)蘇菌液:在無菌條件下取10ml LB液體培養(yǎng)基,加入1%體積的菌液,1‰體積的氨芐青霉素(Amp),37℃培養(yǎng)箱振蕩培養(yǎng)過夜;
- 誘導(dǎo)表達:取500ml LB液體培養(yǎng)基,加1%體積復(fù)蘇好的菌液,1‰體積的氨芐青霉素(Amp),擴大培養(yǎng)至菌液OD600約05-0.8。然后加入IPTG至終濃度為1mmol/L,進行誘導(dǎo)培養(yǎng),5h后結(jié)束誘導(dǎo)(誘導(dǎo)劑濃度、誘導(dǎo)時間可視具體情況而定);
- 收集沉淀:將誘導(dǎo)后的菌液在4℃條件下8000r/min離心15min,收集沉淀。加入0.01mol/L pH7.2的PBS洗滌離心后,再收集沉淀;
- 重懸蛋白:將沉淀反復(fù)快速凍融3-4次,用PH8.0的 Buffer A重懸。然后冰浴中超聲波破碎至溶液不再粘稠后,混勻靜置10min,4℃條件下8000r/min離心10min,收集上清備用。
GST融合蛋白的純化步驟
① 細(xì)胞裂解物與50 %谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂勻漿混合,室溫輕搖使其吸附蛋白30min;
② 4℃,2100r/min條件下離心5min,棄上清,取樣進行SDS-PAGE;
③ 沉淀中加入10倍標(biāo)準(zhǔn)體積的PBS后,顛倒混勻,洗去未結(jié)合的蛋白;
④ 4℃,2100r/min條件下離心5min,棄上清,取樣進行SDS-PAGE;
⑤ 重復(fù)步驟③、④至少2次;
⑥ 將蛋白置于-20℃保存或用谷胱甘肽洗脫緩沖液洗脫GST融合蛋白。
洗脫步驟如下:
- 沉淀中加入1倍柱床體積的谷胱甘肽洗脫緩沖液,室溫輕輕攪動10min;
- 4℃,2100r/min離心5min,取上清;
- 重復(fù)以上兩步驟2次,合并3次的上清。
蛋白濃度的測定
用紫外分光光度計測定純化蛋白樣品在260nm和280nm波長的光吸收值,按照下式計算樣品中蛋白質(zhì)含量。計算公式:蛋白質(zhì)濃度(mg/mL)=(1.45×A280-0.74×A260)×稀釋倍數(shù)。
GST蛋白純化常見問題及建議
目的蛋白結(jié)合效率低或不結(jié)合
- 裂解方式:過分的裂解會使標(biāo)簽蛋白變性,阻止其結(jié)合
- 緩沖液條件:谷胱甘肽-瓊脂糖樹脂在pH值低于6.5或高于8.0時,結(jié)合效率會降低
- 蛋白發(fā)生變性或聚集
- 蛋白或脂類在介質(zhì)中聚集
- 上樣過程:上樣量過載與上樣流速過高均會影響GST標(biāo)簽蛋白的結(jié)合
- GST 融合蛋白發(fā)生聚集沉淀
- GST融合蛋白被過度稀釋
建議:在裂解過程中調(diào)節(jié)合適的超聲功率和間隔時間或采用溫和的機械/化學(xué)裂解方法。
建議:使用前需用pH為6.5~8.0的PBS進行平衡。
建議:使用前需用pH為6.5~8.0的PBS進行平衡。
建議:可在裂解前加入1-10mM的DTT,在緩沖液中也加入DTT;蛋白-核酸結(jié)合或蛋白-蛋白結(jié)合可加氯化鈉。
建議:及時清洗介質(zhì)或更換新的介質(zhì)。
建議:在上樣過程中要注意控制上樣量與保持低流速。
建議:在裂解Buffer和其他緩沖體系中加入DTT
建議:重新濃縮樣品,增加蛋白濃度。
目的蛋白洗脫不下來或洗脫率低
- 洗脫條件
- 樣品沒有經(jīng)過前處理
- 非特異性吸附
- 洗脫緩沖液中谷胱甘肽被氧化
建議:可以通過加大洗脫液體積、降低流速以及延長洗脫液的保留時間等措施提高洗脫效率。
建議:樣品上柱前必須要經(jīng)過離心或過濾。
建議:適當(dāng)選擇添加劑降低非特異性吸附。
建議:洗脫緩沖液需現(xiàn)配現(xiàn)用,另外可以嘗試加入1-5mM的DTT。
洗脫蛋白有雜質(zhì)
- GST融合蛋白被蛋白酶部分降解
- GST融合蛋白被蛋白酶部分降解
建議:加入蛋白酶抑制劑PMSF。注:絲氨酸蛋白酶抑制劑必須在使用凝血酶或凝血因子Xa 前除去。
建議:使用蛋白酶缺陷型菌株lon-或ompT,或ompT和lon雙缺陷型菌株。