利用多肽/蛋白質(zhì)屬性計算工具可以得到蛋白質(zhì)或多肽的序列長度、分子量、等電點等屬性值。
分子量：在進(jìn)行重組表達(dá)前了解表達(dá)蛋白的分子量是十分必要的，分子量過大或過小的蛋白都很難表達(dá)。通過蛋白屬性計算工具可得到蛋白的分子量。如果分子量很小，可以采取融合大標(biāo)簽（GST等）的方式進(jìn)行表達(dá)；如果分子量過大，需采用分段表達(dá)的方式進(jìn)行蛋白表達(dá)。
等電點：每個蛋白質(zhì)的表面都有一定的凈電荷，通過改變PH，可使蛋白質(zhì)表面的凈電荷數(shù)量為0，該PH即為蛋白質(zhì)的等電點。了解蛋白質(zhì)的等電點，對于蛋白質(zhì)的分離純化有重要意義。
其它常用序列分析工具：氨基酸屬性表及分子量分析 、基因重復(fù)序列計算器