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信號肽分析

信號肽通常位于氨基酸序列的N端，是引導(dǎo)新合成的蛋白質(zhì)向分泌通路轉(zhuǎn)移的短肽鏈，一般長度為5~30個氨基酸。信號肽的主要作用是促進蛋白分泌到胞外。在進行重組蛋白表達前，需要對序列進行信號肽預(yù)測，如果預(yù)測結(jié)果為序列中沒有信號肽，則需要在后續(xù)載體構(gòu)建過程中加上一段信號肽，以增加分泌蛋白的表達量。

使用方法

• 輸入序列或上傳FASTA格式的蛋白質(zhì)序列文件
• 選擇物種所屬及SignalP版本
• 填寫位點限制（一般情況使用默認值即可）
• 點擊“提交”按鈕
• 6~10s后可得結(jié)果

把一個或者多個蛋白質(zhì)的氨基酸序列復(fù)制粘貼到下方區(qū)域內(nèi)，序列格式要求為FASTA：

從本地上傳FASTA格式的蛋白質(zhì)序列文件

物種所屬：

真核生物 革蘭氏陰性菌 革蘭氏陽性菌

提交 重置

點擊“提交”按鈕后，會出現(xiàn)等待頁面，請您耐心等待在線分析結(jié)果。

結(jié)果分析

信號肽分析結(jié)果中，包含三個值：S-score、C-score和Y-score。

S-score：每個氨基酸對應(yīng)1個S值，在結(jié)果顯示的圖標(biāo)中有一個曲線顯示S值的變化趨勢，信號肽區(qū)域的S值較高

C-score：剪切位點的值。每個氨基酸會有一個C值，在剪切位點處的C值是最高的。

Y-score：Y值是綜合考慮S值和C值的一個參數(shù)，其比單獨考慮C值要精準(zhǔn)，因為在一系列中C值可能有不止一個較高的位點，但是剪切位點只有一個；此時的剪切位點就由Y-max值來推測，S值是陡峭的位值和具有高C值的位點即為剪切點

其它常用序列分析工具：跨膜區(qū)預(yù)測 、疏水性分析工具 、抗原決定簇預(yù)測(v1)